Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms