Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT3P45378 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms