Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms