Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDFT1P37268 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms