Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6BP35913 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6BP35913 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms