Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT9P35527 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT9P35527 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT9P35527 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms