Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A1P32418 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms