Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR1P32246 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR1P32246 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR1P32246 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR1P32246 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR1P32246 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR1P32246 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms