Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX1P32242 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX1P32242 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX1P32242 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX1P32242 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX1P32242 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms