Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-FP30511 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms