Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK1P30085 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CMPK1P30085 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms