Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK1P29120 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK1P29120 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms