Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB9P28065 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms