Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALRP27797 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALRP27797 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALRP27797 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALRP27797 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALRP27797 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALRP27797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALRP27797 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALRP27797 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALRP27797 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALRP27797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALRP27797 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.2 ms