Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALML3P27482 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALML3P27482 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALML3P27482 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALML3P27482 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALML3P27482 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALML3P27482 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALML3P27482 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALML3P27482 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms