Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA2P26232 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms