Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3P25205 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3P25205 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3P25205 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3P25205 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3P25205 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3P25205 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3P25205 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM3P25205 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM3P25205 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM3P25205 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM3P25205 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM3P25205 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM3P25205 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms