Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRBP23467 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms