Protein–RNA interactions for Protein: P21549

AGXT, Serine--pyruvate aminotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGXTP21549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGXTP21549 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGXTP21549 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGXTP21549 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGXTP21549 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGXTP21549 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGXTP21549 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGXTP21549 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGXTP21549 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGXTP21549 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGXTP21549 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGXTP21549 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGXTP21549 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGXTP21549 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms