Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms