Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DPA1P20036 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms