Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGAM1P18669 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGAM1P18669 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms