Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR1P18146 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR1P18146 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR1P18146 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR1P18146 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR1P18146 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms