Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDGFRAP16234 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms