Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms