Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UCHL3P15374 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UCHL3P15374 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms