Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NID1P14543 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NID1P14543 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NID1P14543 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NID1P14543 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NID1P14543 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NID1P14543 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NID1P14543 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NID1P14543 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NID1P14543 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NID1P14543 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NID1P14543 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms