Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDPSP14324 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDPSP14324 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDPSP14324 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDPSP14324 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDPSP14324 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDPSP14324 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDPSP14324 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDPSP14324 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDPSP14324 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDPSP14324 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDPSP14324 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDPSP14324 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDPSP14324 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FDPSP14324 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDPSP14324 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FDPSP14324 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FDPSP14324 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FDPSP14324 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDPSP14324 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDPSP14324 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FDPSP14324 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDPSP14324 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms