Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYL4P12829 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYL4P12829 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYL4P12829 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYL4P12829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYL4P12829 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYL4P12829 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYL4P12829 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms