Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN1P12814 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms