Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT3P12035 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT3P12035 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT3P12035 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT3P12035 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT3P12035 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT3P12035 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT3P12035 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT3P12035 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT3P12035 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT3P12035 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT3P12035 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms