Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1P11387 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1P11387 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1P11387 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1P11387 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1P11387 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms