Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD8BP10966 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD8BP10966 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD8BP10966 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD8BP10966 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms