Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf89P0DMQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf89P0DMQ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf89P0DMQ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf89P0DMQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf89P0DMQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms