Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2P0DI81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2P0DI81 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms