Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS17P08708 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS17P08708 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS17P08708 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS17P08708 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS17P08708 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS17P08708 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS17P08708 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS17P08708 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS17P08708 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS17P08708 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS17P08708 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS17P08708 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS17P08708 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS17P08708 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS17P08708 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.8 ms