Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA4P06727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA4P06727 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA4P06727 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA4P06727 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA4P06727 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA4P06727 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA4P06727 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms