Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA4P05014 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms