Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFDP00746 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFDP00746 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFDP00746 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFDP00746 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFDP00746 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFDP00746 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFDP00746 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFDP00746 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFDP00746 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFDP00746 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms