Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms