Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4FO95754 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms