Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP4O95707 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP4O95707 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP4O95707 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP4O95707 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP4O95707 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP4O95707 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP4O95707 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP4O95707 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP4O95707 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP4O95707 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP4O95707 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms