Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms