Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPBO95292 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPBO95292 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPBO95292 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VAPBO95292 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VAPBO95292 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPBO95292 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPBO95292 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAPBO95292 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms