Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FARP2O94887 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FARP2O94887 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FARP2O94887 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FARP2O94887 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FARP2O94887 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FARP2O94887 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FARP2O94887 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FARP2O94887 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FARP2O94887 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP2O94887 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP2O94887 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP2O94887 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FARP2O94887 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms