Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC1O94876 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms