Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATP9AO75110 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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