Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG3O60359 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG3O60359 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms