Protein–RNA interactions for Protein: O60353

FZD6, Frizzled-6, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD6O60353 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD6O60353 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD6O60353 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FZD6O60353 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FZD6O60353 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD6O60353 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD6O60353 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD6O60353 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD6O60353 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD6O60353 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FZD6O60353 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD6O60353 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD6O60353 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD6O60353 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms