Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3O43889 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3O43889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3O43889 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3O43889 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3O43889 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3O43889 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3O43889 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3O43889 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms